Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms