Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms