Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLHC1Q8NHS4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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