Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NUP35Q8NFH5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms