Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NAV3Q8IVL0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms