Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP4Q86YS3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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