Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms