Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms