Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB3L3Q68CJ9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms