Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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