Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN4Q5BKX8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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