Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms