Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms