Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NDUFA9Q16795 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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