Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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