Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms