Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms