Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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