Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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NCOA1Q15788 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA1Q15788 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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