Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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