Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABEP1Q15276 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms