Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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