Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SEMA3AQ14563 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEMA3AQ14563 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEMA3AQ14563 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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