Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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