Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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