Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms