Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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