Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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