Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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