Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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