Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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