Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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