Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms