Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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