Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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