Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms