Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms