Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms