Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms