Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms