Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms