Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU5F1Q01860 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms