Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms