Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms