Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms