Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms