Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms