Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms