Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms