Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX16P57768 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX16P57768 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms